Showet starter med at introducere ungdomskammerater med et ganske kraftfuldt og tæt kammeratskab Syaoran, en ung arkæolog, der undersøger en ruin inde i Sakura, og Kingdom of Clow, prinsesse af Kingdom of Clow og datter af den afdøde konge Clow Reed. Når Sakura og Syaoran i ruinerne besøger, antager hendes ånd typen af et sæt vinger, der er spøgelsesagtige, der går i opløsning til andre mål. Syaoran tilfredsstiller den dimensionelle heks, Yuko Ichihara, til hvem han beder om hjælp til at bevare Sakura, da hun går ned i en katatonisk nærdødstilstand. Yuko kan ses af to andre, som hver især har deres særlige ønske: Kurogane, en ninja, der ønsker at vende tilbage til sin husverden efter at være blevet forvist fra sin verden af prinsesse Tomoyo for at sætte ham i stand til at forstå, hvad sand magt er; og Fai D. Flowright, en troldmand, der aldrig ønsker at vende tilbage til sin husverden, Celes, for at forhindre sin konge, Ashura-?. I bytte for magten til at gå på tværs af målinger, har Yuko brug for, at hver enkelt bruger det, de værdsætter mest: hans sværd Ginry tilbydes af Kurogane?; Fai og Syaoran tilbyder den tat, der undertrykker henholdsvis hans enorme magiske styrke og energi og alle Sakuras erindringer, der kalder på ham. Yuko giver derefter et dyr ved navn Mokona Modoki, der sender holdet på en rejse på tværs af målinger på jagt efter Sakuras fjer til dem. Efter at have fået de primære fjer, begynder Sakura at genvinde sine minder og vågner fra sin katatoniske tilstand. I løbet af deres oplevelser vokser gruppen langsomt tættere på det niveau, som de spøgefuldt bliver stemplet af Fai som pårørende. Mens de rejser, opdager de, at fjerene vil give flere unaturlige kræfter til dem, der besidder dem og har deres egne unikke evner.
Under deres rejse i Tokyo opdager holdet, at Syaoran i sandhed er en klon, der er gennemsyret af halvdelen af hjertet af den første Syaoran. For mange år tilbage producerede Fei-klonen for at samle Sakuras fjer, og tryllekunstneren, der fik hendes erindringer til at gå tabt af Sakura, Wang Reed, tog den første Syaoran til fange. Kort efter de første Syaoran-brud af Fei-Wang, bliver hans hjerte tabt af klonen og bliver til en marionetdukke, der følger Fei Wangs vilje og forråder holdet. Den første Syaoran slutter sig til Sakura, der ønsker at redde klonen på holdturen. Da han forudser en anden, hvor Fai dræber den første Syaoran drevet af Fei-Wang, bliver Sakura stukket i sit område, men deler på én gang sjæl og hendes krop og leverer hver til Seresu forskellige verdener såvel som drømmeverdenen. I drømmeverdenen bliver Sakuras sjæl ødelagt af Syaoran-klonen, når han forsøger at få fjerene. Før hendes sjæl går til grunde, viser Sakura, at hun er en klon af den første Sakura, som også var blevet taget til fange af Fei Wang. Fei Wang kræver efterfølgende, at Sakuras krop udnytter sin energi, der er lagret. Holdet tager afsted for at redde de to Sakura'ers forståelse fra Yuko om, at Fei Wang er inden for en alternativ måling i Kongedømmet Clow. En sådan måling, der er parallel, er effekten af Syaorans ønske om at bevare den første Sakura fra Fei Wangs bane for år tilbage. For at tillade sit behov blev Syaoran Fei Wangs fange, og Kimihiro Watanuki, Yukos hjælper, blev brugt til at erstatte Syaoran i baggrunden i hans første verden.
Holdet bekæmper Fei Wang, som ødelægger Syaoran-klonen, da han forråder ham. Derefter bruger han magten fra de to Sakuraer og den umådeligt stærke kraft til at genoplive Yuko, ved et uheld fastfrosset i tid af Clow Reed hendes afgang for at forhindre, hvorved han etablerer sig selv, at Clow ikke er ringere. Yuko bruger Clows magi som betaling og hendes eksistens til at hjælpe med at få klonerne til at blive genfødt før til at bo sammen. Da de 2 forstår, at alle strengens begivenheder ville gentage sig, bliver de selv forseglet af klonerne før konflikten mod ham i Yuko-butikken. Holdet formår at ødelægge Fei Wang, som fanger Syaoran i et tomrum mellem område og tid, og trækker både Watanuki og hans klon med sig som et resultat af linket. Ved at bruge deres ophavsmands afgang forsvinder begge kloner af Syaoran og Sakura og efterlader to fjer. Watanuki og Syaoran undslipper i tomheden for at få en pris: Syaoran skulle fortsætte, mens Watanuki skulle forblive i Yuko-butikken og gennemgå målingerne for evigt. Hvor Fai, Kurogane og Mokona vælger at slutte sig til Syaoran igen i forventning om at få et middel til at genoprette de kloner, der er tilbage som de to fjer, holdet hviler i Kongeriget. Inden Sakura og Syaoran tager afsted på deres forskellige måder, indrømmer de deres nære, gensidigt stærke og rene intime kærlighed til hinanden, som de forventer at opfylde igen.
