"En lang krig mellem græsarealerne og Zexen har taget hårdt. Når en længe tiltrængt våbenhvile mislykkes, påbegyndes en mission for at finde den legendariske Flamme Champion, som reddede græsarealerne i en anden krig år før."
Den tredje af Suikoden-serien fremhæver kampen for bærerne af de 5 elementære True Runes; True Fire Rune, True Water Rune, True Lightning Rune, True Earth Rune og True Wind Rune; midt i det kaos, der opstod i græsarealerne. Hvem er hjernen og hvad er hans/hendes/deres formål?
Baseret på PS2-videospillet er det også løst baseret på Water Margin-klassikerne, selvom det kun er begrænset til indsamlingen af 108 Stars of Destiny for at genoprette orden.
