På gymnasiets første dag afgav Haruhi Suzumiya en meddelelse, der bedøvede alle: ”Jeg har ingen interesse i almindelige mennesker. Hvis nogen her er en fremmed, tidsrejsende, skyder eller esper, kom så se mig! Det er alt." Kyon, et helt normalt menneske, der tilfældigvis har den ulykke at sidde ved skrivebordet foran Haruhi's, undrede sig først om hun var sjov. Men Haruhi Suzumiya er altid seriøs. Altid. Under alle omstændigheder havde Kyon bestemt aldrig til hensigt at blive involveret i hendes narrestreger. Men når en afslappet samtale ved et uheld giver Haruhi ideen om at danne en klub, der er dedikeret til opdagelsen og efterforskningen af mystiske fænomener, finder Kyon sig allerede i overhovedet, især når Haruhi gør ham til sin første ansættelse. Andre medlemmer af klubben inkluderer Nagato Yuki, en stille, boglig pige; Mikuru Asahina, en alt for yndig pige valgt af Haruhi til at være klubbens "maskot"; og Koizumi Itsuki, en altid smilende dreng valgt af Haruhi til at spille rollen som "mystisk transferstudent". Og så er SOS Brigade født! Ting bliver kun mærkeligere og sværere for Kyon, men når han finder ud af, at Haruhi ubevidst har omgivet sig af de mennesker, hun har ønsket hele tiden at opdage: Nagato Yuki er faktisk en fremmed, Asahina Mikuru er en tidsrejsende og Koizumi Itsuki er en esper! Og hvorfor har alle disse mennesker dukket op i første omgang? Hvorfor for Haruhi selvfølgelig! For tre år siden forårsagede Haruhi en slags forstyrrelse, som hver enkelt af dem finder det værd at undersøge. Og Kyon, uanset årsag, ser ud til at være den eneste "normale" i hele gruppen. Hans største spørgsmål: hvorfor ham?
